# ========= [INFO] ==========
# Mut inCB: not accepter mutation in BC
# Mut inMS: 2
# InputBAM: 8-N3-12cycles-IDT.AC20.merged.withUMI.group.identity.bam
# seq_deb : CTCGGTG
# seq_fin : TATGG
# MS_seq : AC
# excl : G,T
# nom  : AC20
# typeF: IDT
# log file: 8-N3-12cycles-IDT.AC20.merged.withUMI.group.identity.AC20.seq.log
# =============================
#
#-------------- Filt ------------------
# condiGrep: CTCG.TGAC.+ACACAC.+AC.ATGG|CTCG.TGAC.+ACACAC.+ACT.TGG|CTCG.TGAC.+ACACAC.+ACTA.GG|CTCG.TGAC.+ACACAC.+ACTAT.G|CTCG.TGAC.+ACACAC.+ACTATG.|CTCGG.GAC.+ACACAC.+AC.ATGG|CTCGG.GAC.+ACACAC.+ACT.TGG|CTCGG.GAC.+ACACAC.+ACTA.GG|CTCGG.GAC.+ACACAC.+ACTAT.G|CTCGG.GAC.+ACACAC.+ACTATG.|CTCGGT.AC.+ACACAC.+AC.ATGG|CTCGGT.AC.+ACACAC.+ACT.TGG|CTCGGT.AC.+ACACAC.+ACTA.GG|CTCGGT.AC.+ACACAC.+ACTAT.G|CTCGGT.AC.+ACACAC.+ACTATG.
# condiSet1: s/\t.*CTCG.TGAC/\tAC/;s/\t.*CTCGG.GAC/\tAC/;s/\t.*CTCGGT.AC/\tAC/
# condiSet2: s/AC.ATGG.*$/AC/;s/ACT.TGG.*$/AC/;s/ACTA.GG.*$/AC/;s/ACTAT.G.*$/AC/;s/ACTATG..*$/AC/
#--------------------------------------
